按照《国务院关于国家重大科研基础设施和大型科研仪器向社会开放的意见》（国发〔2014〕70号）和中央改革办督察组相关要求，根据《国家重大科研基础设施和大型科研仪器开放共享评价考核实施细则》（国科办基〔2022〕93号），科技部、财政部会同有关部门，委托国家科技基础条件平台中心，组织开展了2024年中央级高校和科研院所等单位科研设施与仪器开放共享评价考核工作。
2024年10月14日，科技部办公厅、财政部办公厅发布了《关于发布2024年中央级高校和科研院所等单位重大科研基础设施和大型科研仪器开放共享评价考核结果的通知》（国科办基〔2024〕102号）。中国科学院分子细胞科学卓越创新中心考核结果为“优秀”。本年度共有344家单位参加评价考核，中心排名全国第六、中国科学院第四、上海市第一，这是中心自2018年来第6次在该项评价考核中获得优秀。
